GianMaria
Nuovo Ingresso
Registrato il : 14/03/08
Messaggi : 32
 |  Oggetto: LABORATODIO DI BIONINFORMATICA (HELP)  Sab Giu 21, 2008 8:05 pm | |
| Salve a tutti,
avrei un piccolo problema con il laboratorio di Bioinformatica dovuto alla mia assenza nelle ultime ore di lezione. Mi hanno detto che l'assistente ha spiegato come usare i programmi BLAST e FASTA che, come sto leggendo su internet, sono due programmi per la ricerca di similarità tra proteine.. uno (FASTA) che allinea la proteina in input con tutte quelle che stanno su di un database, naturalmente cercando la similarità solo con sequenze della stessa famiglia proteica, l'altro (BLAST) ne prende due in input e in maniera sempre statistica li allinea... purtroppo non so bene ne dove trovarli, ne come usarli. Qualcuno è così pio da potermi dare qualche dritta direttamente quì nel forum?? Ve ne sarei immensamente grato visto che mancano davvero pochi giorni all'esame!
_________________
Sbrigatevi a laurearvi.. voi studenti fuori corso ci costate!
Sbrigatevi a laurearvi.. non metto gli appelli straordinari perchè se no perdete tempo. |
|
KillerCD
Moderatore
Età : 22
Registrato il : 16/12/07
Messaggi : 348
Localizzazione : Proprio Cosenza Cosenza
| | Oggetto: Re: LABORATODIO DI BIONINFORMATICA (HELP) Dom Giu 22, 2008 12:15 pm | |
| | GianMaria ha scritto: | Salve a tutti,
avrei un piccolo problema con il laboratorio di Bioinformatica dovuto alla mia assenza nelle ultime ore di lezione. Mi hanno detto che l'assistente ha spiegato come usare i programmi BLAST e FASTA che, come sto leggendo su internet, sono due programmi per la ricerca di similarità tra proteine.. uno (FASTA) che allinea la proteina in input con tutte quelle che stanno su di un database, naturalmente cercando la similarità solo con sequenze della stessa famiglia proteica, l'altro (BLAST) ne prende due in input e in maniera sempre statistica li allinea... purtroppo non so bene ne dove trovarli, ne come usarli. Qualcuno è così pio da potermi dare qualche dritta direttamente quì nel forum?? Ve ne sarei immensamente grato visto che mancano davvero pochi giorni all'esame! |
ciao, il prog lo trovi qui http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
puoi inserire sia la sequenza in formato FASTA, sia l'id della proteina.
_________________
Kabir: Se ignori l'albero, non conoscerai la foresta |
|
Indice 
FAQ 
Cerca 
Registrare 
Connessione 
